代謝組是指生物體內源性代謝物質的動態整體。而傳統的代謝概念既包括生物合成，也包括生物分解，因此理論上代謝物應包括核酸、蛋白質、脂類生物大分子以及其他小分子代謝物質。但為了有別于基因組、轉錄組和蛋白質組，代謝組之前只涉及相對分子質量約小于1000的小分子代謝物質，現在以上幾種物質均有囊括。

　　

　　基于功能通路的關聯分析策略：

　　該分析主要基于“參與同一生物過程中的基因或代謝物具有相同或相似的變化規律”。以相同生物學意義為基礎，通過代謝組數據獲得重要差異代謝物或重要代謝通路，聯合轉錄組數據鑒定出重要代謝通路上發生變化的目標基因?；蛘邚霓D錄組數據入手，經過差異分析獲取大量差異基因，再結合代謝組數據，快速鑒定代謝相關的差異功能基因。多環芳烴是一種廣泛存在的持久性環境污染物，可在植物的不同發育階段發揮毒性。植物對多環芳烴的防御機制知之甚少

　　

　　廣泛代謝組應用領域：

　　1、脅迫應答機理研究；

　　2、藥用植物藥用成分合成機理及藥物代謝研究；

　　3、蔬果花卉顏色改良育種；

　　4、動植物生長發育機理研究；

　　5、疾病biomarker篩選；

　　6、疾病發生發展機制研究；

　　7、藥效與毒副作用研究。